Översikt
Ocuco-landskapet KC-Assay-databas (KCAD) är en omfattande katalog över analyser som har använts, eller skulle kunna användas, för att mäta in vivo, ex vivo, in vitro, och in silico endpoints relevanta för var och en av de tio nyckelegenskaperna (KC) hos cancerframkallande ämnen (Rigutto et al., 2025). Det inkluderar analyser som tidigare beskrivits i Smith m.fl., (2020), såväl som analyser som används för att utvärdera mekanistiska bevis på karcinogenicitet relaterad till KC i tidigare IARC-monografierKCAD kan användas för att söka efter analyser och endpoints som är relevanta för KC:erna, vilket förbättrar utvärderingar av cancerrisker. För mer information, se (Rigutto et al., 2025).
Kort orientering
Listvy (standard)
I listvyn kan filter tillämpas på en eller flera KC:er (av cancerframkallande ämnen) av intresse. or ”annan toxicitet” (t.ex. hormonstörningar, hematotoxicitet” etc.). Filter relaterade till experimentell design, såsom studietyp, organismtyp (t.ex. människa, organism etc.), art, vävnad eller cellinje/typ finns också tillgängliga. För att inkludera ytterligare sökkriterier kan användare ange intressetermer i sökfältResultaten kan exporteras som en csv fil.
Pivottabellvy
Pivottabellvyn låter användaren snabbt sammanfatta databasen genom att organisera den i en dynamisk tabell som kan gruppera, filtrera och sortera data. Filter eller sökkriterier som tillämpats på databasen kan visas i pivottabellvy genom att välja “Use filtrerad data för pivotvy” kryssrutan och ”Växla till pivotvy”-knappen. Observera att användaren kan navigera till pivottabellvyn utan att använda filtrerad data. Ytterligare fält, såsom studiedesign (t.ex. in vivo-), organism (t.ex. människa), celltyp (t.ex. PBMC) eller den monografiska kemikalien som studien utvanns ifrån (t.ex. bensen), kan användas för att tillämpa dessa kriterier som filter. Dessa fält kan också dras manuellt till tabellens vertikala eller horisontella axlar för att generera en sammanfattning av de analyser (eller biomarkörer, endpoints etc.) som har mappats till den intressanta KC:n med önskade filter tillämpade (som indikeras av ett (+) tecken i sammanfattningstabellen). Pivottabell resultaten kan också exporteras som en csv fil.
Återkoppling
Byggandet av denna databas avslöjade ett begränsat antal analyser och endpoints associerade med vissa KC:er, vilket pekar på ett behov av analysutveckling. Vänligen skicka in feedback och förslag på ytterligare analyser eller publikationer för inkludering genom att klicka på knappen "Kontakta" eller genom att skicka e-post. kc_assay_database@berkeley.edu.