Visão geral
A Banco de dados KC-Assay (KCAD) é um catálogo abrangente de ensaios que foram ou poderiam ser usados para medir in vivo, ex vivo, in vitro, e in silico pontos finais relevantes para cada uma das dez características-chave (CC) dos carcinógenos (Rigutto e outros, 2025). Inclui ensaios descritos anteriormente em Smith e outros, (2020), bem como ensaios usados para avaliar evidências mecanicistas de carcinogenicidade relacionadas aos KCs em estudos anteriores Monografias IARCO KCAD pode ser usado para pesquisar ensaios e desfechos relevantes para os KCs, aprimorando as avaliações de risco de câncer. Para mais detalhes, consulte (Rigutto e outros, 2025).
Breve Orientação
Visualização de lista (padrão)
Na visualização de lista, os filtros podem ser aplicados a um KC ou KCs (de carcinógenos) de interesse or "outra toxicidade" (por exemplo, desregulação endócrina, hematotoxicidade, etc.). Filtros relacionados ao desenho experimental, como tipo de estudo, tipo de organismo (por exemplo, humano, organismo, etc.), espécie, tecido ou linhagem/tipo celular, também estão disponíveis. Para incorporar critérios de busca adicionais, os usuários podem inserir termos de interesse no campo barra de pesquisa. Os resultados podem ser exportados como um csv arquivo.
Visualização da tabela dinâmica
A visualização da tabela dinâmica permite que o usuário resuma rapidamente o banco de dados, organizando-o em uma tabela dinâmica que pode agrupar, filtrar e classificar dados. Os filtros ou critérios de pesquisa aplicados ao banco de dados podem ser visualizados em visualização de tabela dinâmica selecionando o “Use dados filtrados para Visualização Dinâmica” caixa de seleção e a “Mudar para a visualização dinâmica”. Observe que o usuário pode navegar até a visualização da tabela dinâmica sem usar dados filtrados. Campos adicionais, como o desenho do estudo (por exemplo, in vivo), organismo (por exemplo, humano), tipo de célula (por exemplo, PBMC) ou a substância química da monografia de onde o estudo foi extraído (por exemplo, benzeno) podem ser usados para aplicar esses critérios como filtros. Esses campos também podem ser arrastados manualmente para os eixos vertical ou horizontal da tabela para gerar uma exibição resumida dos ensaios (ou biomarcadores, endpoints, etc.) que foram mapeados para o KC de interesse com os filtros desejados aplicados (conforme indicado pelo sinal (+) na tabela de resumo). Tabela dinâmica os resultados também podem ser exportados como um csv arquivo.
Opiniões sobre o curso
A construção deste banco de dados revelou um número limitado de ensaios e desfechos associados a alguns KCs, apontando para a necessidade de desenvolvimento de ensaios. Envie feedback e sugestões de ensaios ou publicações adicionais para inclusão clicando no botão "Contato" ou enviando um e-mail para kc_assay_database@berkeley.edu.