Overzicht
De KC-Assay-database (KCAD) is een uitgebreide catalogus van testen die zijn gebruikt of kunnen worden gebruikt om in vivo, ex vivo, in vitro, en in silicium eindpunten die relevant zijn voor elk van de tien belangrijkste kenmerken (KC) van kankerverwekkende stoffen (Rigutto et al., 2025). Het omvat eerder beschreven analyses in Smith et al., (2020), evenals testen die gebruikt worden om mechanistisch bewijs te evalueren van carcinogeniciteit gerelateerd aan de KCs in eerdere IARC-monografieënKCAD kan worden gebruikt om te zoeken naar assays en eindpunten die relevant zijn voor de KC's, waardoor de evaluatie van kankerrisico's wordt verbeterd. Zie ( voor meer informatie)Rigutto et al., 2025).
Korte oriëntatie
Lijstweergave (standaard)
In de lijstweergave kunnen filters worden toegepast op een of meer kankerverwekkende stoffen (KC's) van belang , of op 'andere toxiciteit' (bijv. hormoonontregeling, hematotoxiciteit, enz.). Filters met betrekking tot het experimenteel ontwerp, zoals studietype, organismetype (bijv. mens, organisme, enz.), soort, weefsel of cellijn/celtype, zijn ook beschikbaar. Om aanvullende zoekcriteria toe te voegen, kunnen gebruikers zoektermen invoeren in de zoekbalk . Resultaten kunnen worden geëxporteerd als een csv- bestand.
Draaitabelweergave
Met de draaitabelweergave kan de gebruiker de database snel samenvatten door deze te organiseren in een dynamische tabel waarin gegevens kunnen worden gegroepeerd, gefilterd en gesorteerd. Filters of zoekcriteria die op de database zijn toegepast, kunnen in de draaitabelweergave worden bekeken door het selectievakje ' Gefilterde gegevens gebruiken voor draaitabelweergave ' aan te vinken en op de knop ' Schakel over naar draaitabelweergave ' te klikken. Houd er rekening mee dat de gebruiker ook naar de draaitabelweergave kan navigeren zonder gefilterde gegevens te gebruiken. Aanvullende velden, zoals onderzoeksopzet (bijv. in vivo ), organisme (bijv. mens), celtype (bijv. PBMC) of de monografie van de chemische stof waaruit de studie is afgeleid (bijv. benzeen), kunnen worden gebruikt om deze criteria als filters toe te passen. Deze velden kunnen ook handmatig naar de verticale of horizontale as van de tabel worden gesleept om een overzicht te genereren van de analyses (of biomarkers, eindpunten, enz.) die zijn gekoppeld aan de betreffende KC met de gewenste filters (aangegeven met een (+) teken in de overzichtstabel). De resultaten van de draaitabel kunnen ook worden geëxporteerd als een csv- bestand.
Feedback
Het opbouwen van deze database bracht een beperkt aantal testen en eindpunten aan het licht die verband houden met sommige KC's, wat wijst op de noodzaak van verdere testontwikkeling. U kunt feedback en suggesties voor aanvullende testen of publicaties indienen door op de knop "Contact" te klikken of door een e-mail te sturen naar kc_assay_database@berkeley.edu.