Overzicht
De KC-Assay-database (KCAD) is een uitgebreide catalogus van testen die zijn gebruikt of kunnen worden gebruikt om in vivo, ex vivo, in vitro, en in silicium eindpunten die relevant zijn voor elk van de tien belangrijkste kenmerken (KC) van kankerverwekkende stoffen (Rigutto et al., 2025). Het omvat eerder beschreven analyses in Smith et al., (2020), evenals testen die gebruikt worden om mechanistisch bewijs te evalueren van carcinogeniciteit gerelateerd aan de KCs in eerdere IARC-monografieënKCAD kan worden gebruikt om te zoeken naar assays en eindpunten die relevant zijn voor de KC's, waardoor de evaluatie van kankerrisico's wordt verbeterd. Zie ( voor meer informatie)Rigutto et al., 2025).
Korte oriëntatie
Lijstweergave (standaard)
In de lijstweergave kunnen filters worden toegepast op een of meer KC's (van kankerverwekkende stoffen) van belang or "andere toxiciteit" (bijv. hormoonontregeling, hematotoxiciteit, enz.). Filters gerelateerd aan experimenteel ontwerp, zoals studietype, type organisme (bijv. mens, organisme, enz.), soort, weefsel of cellijn/type zijn ook beschikbaar. Om aanvullende zoekcriteria op te nemen, kunnen gebruikers zoektermen invoeren in de zoekbalkResultaten kunnen worden geëxporteerd als een csv bestand.
Draaitabelweergave
Met de draaitabelweergave kan de gebruiker de database snel samenvatten door deze te organiseren in een dynamische tabel. Hierin kunnen gegevens worden gegroepeerd, gefilterd en gesorteerd. Filters of zoekcriteria die op de database zijn toegepast, kunnen worden bekeken in draaitabelweergave door de "Ugefilterde gegevens voor draaitabelweergave” selectievakje en het “Overschakelen naar draaiweergave"-knop. Houd er rekening mee dat de gebruiker naar de draaitabelweergave kan navigeren zonder gefilterde gegevens te gebruiken. Aanvullende velden, zoals onderzoeksopzet (bijv. in vivo), organisme (bijv. mens), celtype (bijv. PBMC) of de monografie-chemische stof waaruit de studie is afgeleid (bijv. benzeen), kunnen worden gebruikt om deze criteria als filters toe te passen. Deze velden kunnen ook handmatig naar de verticale of horizontale assen van de tabel worden gesleept om een samenvattende weergave te genereren van de assays (of biomarkers, eindpunten, enz.) die zijn toegewezen aan de KC van interesse, met de gewenste filters toegepast (zoals aangegeven door een (+) teken in de samenvattende tabel). Draaitabel resultaten kunnen ook worden geëxporteerd als een csv bestand.
Feedback
Bij het bouwen van deze database is een beperkt aantal assays en eindpunten aan het licht gekomen die verband houden met sommige KC's, wat wijst op de noodzaak van assay-ontwikkeling. U kunt feedback en suggesties voor aanvullende assays of publicaties indienen door te klikken op de knop 'Contact' of door een e-mail te sturen naar kc_assay_database@berkeley.edu.